Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD8O14715 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD8O14715 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD8O14715 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD8O14715 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD8O14715 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD8O14715 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD8O14715 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD8O14715 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
RGPD8O14715 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD8O14715 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms