Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN25C9JDP6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN25C9JDP6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms