Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIN4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIN4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A6NIN4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIN4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIN4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NIN4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NIN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NIN4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NIN4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NIN4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NIN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NIN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NIN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NIN4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NIN4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NIN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
A6NIN4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NIN4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NIN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NIN4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A6NIN4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NIN4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NIN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NIN4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NIN4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NIN4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NIN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NIN4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NIN4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NIN4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NIN4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NIN4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A6NIN4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NIN4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NIN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NIN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NIN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NIN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NIN4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NIN4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NIN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NIN4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NIN4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NIN4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NIN4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NIN4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NIN4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A6NIN4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A6NIN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A6NIN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A6NIN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
A6NIN4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A6NIN4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms