Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARGC1BQ86YN6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms