Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF1AQ16665 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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