Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC24CP53992 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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