Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SFTPBP07988 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SFTPBP07988 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SFTPBP07988 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SFTPBP07988 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFTPBP07988 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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