RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.43■■■■□ 3.58
PANX1-201ENST00000227638 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.51■■■□□ 2.79
PANX1-201ENST00000227638 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PANX1-201ENST00000227638 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.76■■■□□ 2.68
PANX1-201ENST00000227638 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.62■■■□□ 2.65
PANX1-201ENST00000227638 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
PANX1-201ENST00000227638 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.7■■■□□ 2.51
PANX1-201ENST00000227638 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.7■■■□□ 2.5
PANX1-201ENST00000227638 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.49■■■□□ 2.47
PANX1-201ENST00000227638 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.19■■■□□ 2.42
PANX1-201ENST00000227638 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.15■■■□□ 2.42
PANX1-201ENST00000227638 ABCC9O60706 1549 aa30.09■■■□□ 2.41
PANX1-201ENST00000227638 SCRIBQ14160 1630 aa30.06■■■□□ 2.4
PANX1-201ENST00000227638 HRCP23327 699 aa29.86■■■□□ 2.37
PANX1-201ENST00000227638 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PANX1-201ENST00000227638 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.73■■■□□ 2.35
PANX1-201ENST00000227638 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
PANX1-201ENST00000227638 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
PANX1-201ENST00000227638 NACADO15069 1562 aa29.5■■■□□ 2.31
PANX1-201ENST00000227638 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.39■■■□□ 2.3
PANX1-201ENST00000227638 TRIM41Q8WV44 630 aa29.38■■■□□ 2.29
PANX1-201ENST00000227638 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.29■■■□□ 2.28
PANX1-201ENST00000227638 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.19■■■□□ 2.26
PANX1-201ENST00000227638 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PANX1-201ENST00000227638 WIZO95785 1651 aa29.04■■■□□ 2.24
PANX1-201ENST00000227638 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
PANX1-201ENST00000227638 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.78■■■□□ 2.2
PANX1-201ENST00000227638 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PANX1-201ENST00000227638 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
PANX1-201ENST00000227638 SMARCA4P51532 1647 aa28.56■■■□□ 2.16
PANX1-201ENST00000227638 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.43■■■□□ 2.14
PANX1-201ENST00000227638 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.42■■■□□ 2.14
PANX1-201ENST00000227638 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PANX1-201ENST00000227638 ABCC8Q09428 1581 aa28.4■■■□□ 2.14
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PANX1-201ENST00000227638 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PANX1-201ENST00000227638 SMARCA2P51531 1590 aa28.32■■■□□ 2.12
PANX1-201ENST00000227638 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PANX1-201ENST00000227638 SOGA1O94964 1423 aa28.19■■■□□ 2.1
PANX1-201ENST00000227638 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PANX1-201ENST00000227638 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.12■■■□□ 2.09
PANX1-201ENST00000227638 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PANX1-201ENST00000227638 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PANX1-201ENST00000227638 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.94■■■□□ 2.06
PANX1-201ENST00000227638 CEP162Q5TB80 1403 aa27.93■■■□□ 2.06
PANX1-201ENST00000227638 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.93■■■□□ 2.06
PANX1-201ENST00000227638 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.88■■■□□ 2.05
PANX1-201ENST00000227638 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PANX1-201ENST00000227638 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PANX1-201ENST00000227638 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
PANX1-201ENST00000227638 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.7■■■□□ 2.03
PANX1-201ENST00000227638 SYNJ1O43426 1573 aa27.7■■■□□ 2.02
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
PANX1-201ENST00000227638 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PANX1-201ENST00000227638 EEA1Q15075 1411 aa27.53■■■□□ 2
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA3Q08378 1498 aa27.51■■□□□ 1.99
PANX1-201ENST00000227638 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PANX1-201ENST00000227638 NEUROD1Q13562 356 aa27.49■■□□□ 1.99
PANX1-201ENST00000227638 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.4■■□□□ 1.98
PANX1-201ENST00000227638 CLIP1P30622 1438 aa27.38■■□□□ 1.97
PANX1-201ENST00000227638 NCAPD3P42695 1498 aa27.36■■□□□ 1.97
PANX1-201ENST00000227638 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.33■■□□□ 1.97
PANX1-201ENST00000227638 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PANX1-201ENST00000227638 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PANX1-201ENST00000227638 HMGXB3Q12766 1538 aa27.27■■□□□ 1.96
PANX1-201ENST00000227638 APLP2Q06481 763 aa27.26■■□□□ 1.96
PANX1-201ENST00000227638 TOP2BQ02880 1626 aa27.26■■□□□ 1.95
PANX1-201ENST00000227638 KIF21BO75037 1637 aa27.22■■□□□ 1.95
PANX1-201ENST00000227638 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.2■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 CUX1P39880 1505 aa27.17■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.14■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PANX1-201ENST00000227638 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.12■■□□□ 1.93
PANX1-201ENST00000227638 CFTRP13569 1480 aa27.1■■□□□ 1.93
PANX1-201ENST00000227638 MIER1Q8N108 512 aa27.09■■□□□ 1.93
PANX1-201ENST00000227638 ITGAEP38570 1179 aa27.05■■□□□ 1.92
PANX1-201ENST00000227638 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PANX1-201ENST00000227638 PRXQ9BXM0 1461 aa26.95■■□□□ 1.91
PANX1-201ENST00000227638 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.95■■□□□ 1.9
PANX1-201ENST00000227638 KIF27Q86VH2 1401 aa26.93■■□□□ 1.9
PANX1-201ENST00000227638 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.91■■□□□ 1.9
PANX1-201ENST00000227638 ARAP1Q96P48 1450 aa26.88■■□□□ 1.89
PANX1-201ENST00000227638 CUX2O14529 1486 aa26.83■■□□□ 1.89
PANX1-201ENST00000227638 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
PANX1-201ENST00000227638 P3H3Q8IVL6 736 aa26.81■■□□□ 1.88
PANX1-201ENST00000227638 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.75■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 NESP48681 1621 aa26.73■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 IGF1RP08069 1367 aa26.73■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 PRDM2Q13029 1718 aa26.72■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.7■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.65■■□□□ 1.86
PANX1-201ENST00000227638 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.62■■□□□ 1.85
PANX1-201ENST00000227638 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.62■■□□□ 1.85
PANX1-201ENST00000227638 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
PANX1-201ENST00000227638 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PANX1-201ENST00000227638 KCNH8Q96L42 1107 aa26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.6 ms