Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC24CP53992 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms