Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TK1P04183 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TK1P04183 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TK1P04183 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TK1P04183 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TK1P04183 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms