Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN7Q9Y6W3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN7Q9Y6W3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN7Q9Y6W3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms