Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E3Q9Y5X4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E3Q9Y5X4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR2E3Q9Y5X4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NR2E3Q9Y5X4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NR2E3Q9Y5X4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E3Q9Y5X4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E3Q9Y5X4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.2 ms