Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GTF3C3Q9Y5Q9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms