Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SORCS3Q9UPU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SORCS3Q9UPU3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SORCS3Q9UPU3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms