Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSRAQ9UJ68 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSRAQ9UJ68 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MSRAQ9UJ68 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSRAQ9UJ68 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms