Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3KQ9UBQ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF3KQ9UBQ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3KQ9UBQ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms