Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSD3Q9NYI0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSD3Q9NYI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSD3Q9NYI0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms