Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC17Q9NVM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAJC17Q9NVM6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAJC17Q9NVM6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAJC17Q9NVM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms