Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A5

CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10Q9H9A5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT10Q9H9A5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNOT10Q9H9A5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT10Q9H9A5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms