Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLIRPQ9GZT3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLIRPQ9GZT3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLIRPQ9GZT3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms