Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX6-2Q9C056 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX6-2Q9C056 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX6-2Q9C056 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX6-2Q9C056 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms