Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP1Q9C000 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
NLRP1Q9C000 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NLRP1Q9C000 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NLRP1Q9C000 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms