Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFHD1Q9BUP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFHD1Q9BUP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFHD1Q9BUP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms