Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GL3Q99963 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3GL3Q99963 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3GL3Q99963 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3GL3Q99963 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms