Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRRT1Q99946 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRRT1Q99946 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms