Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED4Q96RK1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms