Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRAMD1AQ96CP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRAMD1AQ96CP6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1AQ96CP6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1AQ96CP6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms