Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF3Q92576 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF3Q92576 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF3Q92576 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms