Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPS9Q8WXC6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS9Q8WXC6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms