Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC13A3Q8WWT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC13A3Q8WWT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC13A3Q8WWT9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms