Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC4Q8WW27 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC4Q8WW27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms