Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC197Q8NCU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC197Q8NCU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC197Q8NCU1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC197Q8NCU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms