Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PNLDC1Q8NA58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNLDC1Q8NA58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNLDC1Q8NA58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms