Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHFPL3Q86UP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHFPL3Q86UP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms