Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX8Q6ZV50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFX8Q6ZV50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms