Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MLIPQ5VWP3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MLIPQ5VWP3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MLIPQ5VWP3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLIPQ5VWP3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms