Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF220Q5VTB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF220Q5VTB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF220Q5VTB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF220Q5VTB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms