Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM48Q5RL73 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM48Q5RL73 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM48Q5RL73 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM48Q5RL73 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms