Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYDC2Q56P42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PYDC2Q56P42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PYDC2Q56P42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PYDC2Q56P42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms