Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF3Q3KNV8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF3Q3KNV8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms