Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL24A1Q17RW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
COL24A1Q17RW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
COL24A1Q17RW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
COL24A1Q17RW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
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