Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDO1Q16878 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDO1Q16878 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDO1Q16878 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDO1Q16878 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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