Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNXAQ16473 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNXAQ16473 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms