Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF4Q15306 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF4Q15306 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF4Q15306 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF4Q15306 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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