Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMQ13315 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMQ13315 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMQ13315 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATMQ13315 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATMQ13315 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATMQ13315 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATMQ13315 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATMQ13315 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATMQ13315 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ATMQ13315 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATMQ13315 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATMQ13315 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATMQ13315 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATMQ13315 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATMQ13315 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATMQ13315 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATMQ13315 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATMQ13315 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATMQ13315 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATMQ13315 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATMQ13315 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATMQ13315 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATMQ13315 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATMQ13315 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATMQ13315 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATMQ13315 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATMQ13315 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATMQ13315 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATMQ13315 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATMQ13315 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATMQ13315 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATMQ13315 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATMQ13315 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATMQ13315 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATMQ13315 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATMQ13315 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATMQ13315 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATMQ13315 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATMQ13315 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATMQ13315 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATMQ13315 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMQ13315 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMQ13315 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMQ13315 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMQ13315 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMQ13315 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMQ13315 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMQ13315 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMQ13315 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMQ13315 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMQ13315 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMQ13315 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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