Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPRL3Q12980 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPRL3Q12980 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPRL3Q12980 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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