Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF2Q12772 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SREBF2Q12772 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF2Q12772 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
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