Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC45.26■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
HMGXB3Q12766 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC45.24■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
HMGXB3Q12766 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.17■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
HMGXB3Q12766 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC45.08■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
HMGXB3Q12766 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC45.05■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC45.04■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC45.01■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
HMGXB3Q12766 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
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