Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN3Q08043 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN3Q08043 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN3Q08043 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN3Q08043 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms