Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP1-1Q07627 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP1-1Q07627 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms